In oktober 2019 legde Tom Ongena zijn eed af als Vlaams parlementslid in opvolging van Bart Somers die opnieuw Vlaams minister werd.

In het parlement zetelt Tom in de commissies 'Binnenlands Bestuur, Gelijke Kansen en Inburgering', 'Economie, Werk, Sociale Economie, Wetenschap en Innovatie', 'Onderwijs' en de commissie 'voor de

Bestrijding van Gewelddadige Radicalisering'.

Sinds oktober 2020 zetelt Tom ook in de Senaat als deelstaatsenator.

In zijn woonplaats Sint-Katelijne-Waver zetelt Tom als gemeenteraadslid.

In juli 2023 werd Tom waarnemend voorzitter van Open Vld.